这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪...在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
这是五十年后的未来，世界被“神”吞噬殆尽而荒芜的架空故事。 由于遭到突如其来的怪物“荒神”的破坏而失去平衡。在人类文明既有的兵器都因荒神的“捕食”本能而无效化下，生化科技企业“芬里尔”成功利用荒神细胞开发出了名为“神机”的生物兵器。并同时组织了特殊部队“GOD EATER”。自此，人类终于获得了与荒神对抗的力量。
本作围绕着高中生的日常生活，讲述了在“炼金术”盛行的时代中，青年人们为了守护正义...
「听好了，康斯坦丝．葛莱尔。妳就算花费一生时间，也必须让我的复仇成功！」只有诚实勉强算是优点的平凡子爵千金康妮，在某一次宴会上被抢走未婚夫，还被诬陷是窃盗犯，因而陷入走投无路的绝境。就在这种情况下，10年前被处刑的绝代恶女史嘉蕾．卡斯提奥的亡灵出现在她眼前！过去曾经以其绝世美貌、高贵血统，以及压倒性的出众气质而被赞誉为社交界至宝的史嘉蕾，附身在康妮身上之后没两三下子就逆转局势，让康妮得以逃出险境。但是，康妮须要付出的代价，却是帮忙史嘉蕾复仇！ ？刚开始是因为利害一致而合作的两人，在不断击溃贵族社会各种暗中恶意和阴谋的过程中建立了情谊，成长为真正的搭档，最后踏上跟过去一直持续至今的巨大阴谋针锋相对的道路……！
女高中生铃木的个性开朗、交友甚广、擅长察言观色，是班上的中心人物之一，她喜欢的对象是坐在自己隔壁的男同学谷，而谷的个性与铃木恰恰相反，他内敛沉稳、有主见、待人一视同仁。铃木一直无法鼓起勇气告白，直到某日一个偶然机会，两人放学回家时走在同一条路上，并因此牵起了手。之后两人相互倾诉对彼此的好感，并开始交往，而同学们虽然感到讶异，但也都很支持两人的恋情。
